Net als de temperatuur hebben micro-organismen ook een pH-bereik met een minimum, maximum en optimum. Veel micro-organismen groeien het beste bij een pH van 7. Sommige bacteriën en schimmels overleven een pH van 0,8. Organismen die groeien bij een lage pH worden acidofielen genoemd. In het spijsverteringssysteem zijn ook veel verschillende pH’s;

• Speeksel: Is ongeveer 7,1 licht alkalisch of neutraal.
• Maagsap: Is het meest zure bestanddeel van het lichaam. Maagsap ligt tussen pH 1,2 en 3,0. Het zure maagsap is nodig voor de vertering van de eiwitten en het doden van de ziekteverwekkers die via de ademhaling binnen komen of samen met het voedsel ingeslikt worden.
• Alvleesklier: De afscheiding van de alvleesklier bevindt zich tussen pH 8,0 ver in het basisch bereik. De afscheiding dient ervoor om de zure voeding uit de maag te neutraliseren in de twaalfvingerige darm, zodat de voedingsstoffen via de dunne darm door het lichaam kunnen worden opgenomen.
• Darmen: Heeft een waarde van pH 8,0 of hoger, dit ligt duidelijk in een alkalisch milieu.